Diversidad genética y filogenia del género Cinchona en el Parque Nacional de Cutervo, Perú

Karla Andrea  Peña Yacila; Erick Antonio  Suarez-Peña; Carlos Alberto  Torres Pera; Luis Alberto  Bermejo Requena; Luis Xavier  Llacsa Sánchez; Iris  Zárate Rodríguez; Oscar Junior  Paredes-Vilca; José Yasser  Dávila García

doi:10.17268/sci.agropecu.2021.056

Authors

Karla Andrea Peña Yacila Universidad Nacional de Tumbes, Laboratorio Microbiología, Av. Universitaria S/N Pampa Grande – Tumbes https://orcid.org/0000-0002-3804-3837
Erick Antonio Suarez-Peña Instituto Nacional de Innovación Agraria (INIA), Estación Experimental Agraria Los Cedros, km 12-Panamericana Norte-Caserío los Cedro, Tumbes https://orcid.org/0000-0003-0137-8251
Carlos Alberto Torres Pera Universidad Nacional Mayor de San marcos, Facultad de Ciencias Biológicas, Av. Carlos Germán Amézaga 375 - Edificio Jorge Basadre, Ciudad Universitaria, Lima https://orcid.org/0000-0003-1608-6622
Luis Alberto Bermejo Requena Universidad Nacional de Tumbes, Laboratorio Microbiología, Av. Universitaria S/N Pampa Grande – Tumbes https://orcid.org/0000-0001-5294-7034
Luis Xavier Llacsa Sánchez Inca’Biotec SAC- Perú, departamento de Sanidad Vegetal, Jr. Filipinas 212, Tumbes https://orcid.org/0000-0002-7463-4394
Iris Zárate Rodríguez Servicio Nacional de Áreas Naturales Protegidas por el Estado-SERNANP, Av. San Juan 724, Cutervo-Cajamarca
Oscar Junior Paredes-Vilca Universidad Nacional Agraria La Molina-UNALM, Av. La Molina s/n, La Molina https://orcid.org/0000-0003-2301-3675
José Yasser Dávila García Universidad Nacional Agraria La Molina-UNALM, Av. La Molina s/n, La Molina https://orcid.org/0000-0002-1310-1690

DOI:

https://doi.org/10.17268/sci.agropecu.2021.056

Keywords:

Conservation, Cinchona tree, haplotype diversity, nucleotide diversity, matK marker

Abstract

Species of the genus Cinchona are recognized for their effectiveness in treating malaria. For Peru, this genus is of greater importance regarding forestry and civic aspects, because it represents the richness of the plant resource. Nevertheless, nowadays Cinchona populations are strongly threatened by various anthropogenic activities. Cutervo National Park (PNC) is the Peruvian's first Protected Natural Area (ANP) and is considered as a conservation unit for the genus Cinchona. Objective: Determine the genetic diversity and phylogenetic relationships of the species of the genus Cinchona that inhabit the PNC. Methods: We tested 13 samples using the matK marker and a phylogenetic tree was generated using the maximum likelihood method and bootstrap measures of phylogenetic support. Results: 8 number of haplotypes (h) were recorded, with haplotype diversity (Hd) 0.859 and nucleotide diversity (π) 0.35%, also identifying: C. calisaya, C. pubescens and C. pitayensis for the PNC; the phylogenetic tree showed C. pitayensis as conserved specie, meanwhile C. pubsecens is present in many groups. Conclusions: The high genetic diversity of Cinchona and haplotype record of C. calisaya, species with a national conservation category of "Vulnerable", increases the importance for biodiversity conservation of the PNC.

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