Diversidad genética de Ucides occidentalis (Ortmann 1897) (Crustacea: Decapoda: Brachiura) basada en el gen 16S ARNr en Tumbes, Perú
DOI:
https://doi.org/10.17268/sci.agropecu.2018.02.11Palavras-chave:
Ucides occidentalis, gen 16S ARNr, manglar, diversidad genética.Resumo
El cangrejo del manglar Ucides occidentalis es una especie clave en el manglar pues recicla hasta el 84% de su hojarasca, así también es el cangrejo más explotado en la región Tumbes, tanto así que su población se ha reducido drásticamente, hasta 35,8% en 11 años, esta situación puede llevar a que se necesite hacer su repoblamiento, el que para ser adecuadamente realizado requiere del conocimiento de su genética poblacional. En esta investigación se buscó determinar la diversidad genética de U. occidentalis en el manglar de Tumbes, en base al estudio de un fragmento del gen 16S ARNr. De 38 muestras de ADN de U. occidentalis recolectados del manglar de Tumbes, se amplificó y secuenció fragmentos del gen 16S ARNr, los que al ser analizados indicaron polimorfismo (tasa de polimorfismo de 52,64%), una alta diversidad genética (indicada por el alto número de haplotipos: 16 y la diversidad de haplotipos: 0,721; así como por el promedio de diferencias en nucleótidos: 1,677 y la diversidad nucleótida: 0,00381), así como una baja estructura genética poblacional (evaluada mediante AMOVA con variabilidad genética entre poblaciones de 11%). De igual manera se evidenció que no existió relación entre la distancia genética y la distancia geográfica (coeficiente de correlación de Pearson del test de Mantel, r = -0,003).
Referências
Alemán, S.; Ordinola, E. 2017. Ampliación de la distribución sur de Ucides occidentalis (Decapoda: Ucididae) y Cardisoma crassum (Decapoda: Gecarcinidae). Revista Peruana de Biología 24(1): 107.
Alves, L. 2013. Estrutura genética e demográfica do caranguejo-uçá (Ucides cordatus) na costa do Brasil. Tesis de maestría, Universidad Federal del Espíritu Santo, Vitória. Brasil. 40 pp.
Amaral, M.; Albrecht, M.; McKinley, A.; de Carvalho, A.; Cavalcante de Sousa, S.; Diniz, F. 2015. Mitochondrial DNA variation reveals a sharp genetic break within the distribution of the blue land crab Cardisoma guanhumi in the Western Central Atlantic. Molecules 20(8): 15158-15174
Amaral, M.R.X. 2014. Genética populacional do Cardisoma guanhumi por meio da região controle do DNA mitochondrial. Tesis de maestría, Universidad Federal del Piauí, Teresina. Brasil. 92 pp.
Arif, I.A.; Khan, H.A. 2009. Molecular markers for biodiversity analysis of wildlife animals: a brief review. Animal Biodiversity and Conservation 32(1): 9–17.
Banci, K.R. da S.; Mori, G.M.; Oliveira, M.A.; Paganelli, F.L.; Pereira, M.R.; Pinheiro, M.A.A. 2017. Can environmental pollution by metals change genetic diversity? Ucides cordatus (Linnaeus, 1763) as a study case in Southeastern Brazilian mangroves. Marine Pollution Bulletin 116(1-2): 440-447
Barrera, M.G. 2016. Análisis de la variación y la estructura genética de la centolla (Lithodes santolla, Molina, 1782) en la región de Magallanes y Antártica chilena, mediante marcadores molecu-lares. Tesis de maestría, Centro de Investigaciones Biológicas en el Noroeste, S. C., La Paz. México. 117 pp.
Britto, F.B.; Diniz, F.M.; Paterson, I.; Bentzen, P. 2009. Polymorphic microsatellite DNA markers in the mangrove crab Ucides cordatus (Brachyura: Ocypodidae). Molecular Ecology Resources 9: 1249–1252
Cottens, K.F. 2009. Efeitos da temperatura, intensidade luminosa e da densidade de cultivo na larvicultura de Ucides cordatus (Linnaeus, 1763) (Crustacea, Decapoda. Brachyura) em laboratorio. Tesis de maestría, Universidad Federal del Paraná, Paraná. Brasil. 82 pp.
de Oliveira-Neto, J.F.; Baggio, R.A.; Ostrensky, A.; Chammas, M.A.; Boeger, W.A. 2014. Assessing the genetic diversity and gene flow of populations of the crab Ucides cordatus (Decapoda: Ocypodidae) on the Brazilian Coast using microsatellite markers. Journal of Crustacean Biology 34(1): 70-75
Ewald, M. 2006. Isolation and characterization of nuclear and mitochondrial genetic markers for population studies of Ucides cordatus cordatus (Decapoda: Brachyura). Tesis de doctorado, Universidad de Bremen. Bremen, Alemania. 101 pp.
Fratini, S.; Cannicci, S.; Schubart, C. D. 2018. Molecular phylogeny of the crab genus Metopograpsus H. Milne Edwards, 1853 (Decapoda : Brachyura : Grapsidae) reveals high intraspecific genetic variation and distinct evolutionarily significant units. Invertebrate Systematics 32(1): 215.
Gama-Maia, D.J.; Torres, R.A. 2016. Fine-scale genetic structuring, divergent selection, and conservation prospects for the overexploited crab (Cardisoma guanhumi) in tropical mangroves from North-eastern Brazil. Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom 96(08): 1677-1686.
García, R.; Risco, M.C. 2015. Diversidad genética y estructura genética poblacional del cangrejo del manglar (Ucides occidentalis) utilizando la región de control mitocondrial y el gen del citocromo oxidasa I. Tumbes 2014. Tesis de ingeniero, Universidad Nacional de Tumbes, Tumbes. Perú. 80 pp.
González, A. 2008. Análisis de la diversidad genética en poblaciones naturales de especies vegetales ame-nazadas: Ilex perado ssp. lopezlilloi (Aquifoliaceae), Silene nocteolens (Caryophyllaceae) y Sorbus aria (Rosaceae). Resultados preliminares. Tesis de doctorado, Universidad de las Palmas de Gran Canaria, Palmas de Gran Canaria. España. 59 pp.
Hague, M.T.J.; Routman, E. J. 2016. Does population size affect genetic diversity? A test with sympatric lizard species. Heredity 116(1): 92-98
Hui, M.; Nuryanto, A.; Kochzius, M. 2017. Concordance of microsatellite and mitochondrial DNA markers in detecting genetic population structure in the boring giant clam Tridacna crocea across the Indo-Malay Archipelago. Marine Ecology 38(1): e12389.
Marochi, M.Z.; Masunari, S.; Schubart, C.D. 2017. Genetic and morphological differentiation of the semiterrestrial crab Armases angustipes (Brachyura: Sesarmidae) along the Brazilian Coast. The Biological Bulletin 232(1): 30-44.
Mijangos, J.L.; Pacioni, C.; Spencer, P.B.S.; Craig, M.D. 2015. Contribution of genetics to ecological restoration. Molecular Ecology 24(1): 22-37.
Oliveira, J.F. 2009. Filogeografia e demografia evolutiva de Ucides cordatus (Linnaeus 1763) (decapoda, brachyura) e Cardisoma guanhumi Latreille, 1825 (decapoda, brachyura) na costa do Brasil. Tesis de doctor, Universidad Federal del Paraná, Paraná. Brasil. 116 pp.
Ordinola, E.; Montero, P.; Gonzáles, I. 2010. Prospección bio ecológica de cangrejo del manglar (Ucides occidentalis) en la Región Tumbes, 07 al 13 Julio 2009. Instituto del Mar del Perú. Tumbes, Perú. 20 pp.
Ordinola-Zapata, A. 2012. Diversidad y estructura genética poblacional del cangrejo del manglar (Ucides occidentalis) en la región Tumbes. 2012. Tesis de maestría, Universidad Nacional de Tumbes, Tumbes. Perú. 81 pp.
Orélis-Ribeiro, R.; Vicente, V.A.; Ostrensky, A.; Chammas, M.A.; Boeger, W.A. 2017. Is Marine Dispersion of the Lethargic Crab Disease Possible? Assessing the tolerance of Exophiala cancerae to a broad combination of salinities, temperatures, and exposure times. Mycopathologia 182(11-12): 997-1004
Palumbi, S.; Martin, A.; Romano, S.; Mcmillan, W.O.; Stice, L.; Grabowski, G. 1991. The simple fool's guide to PCR. Kewalo Marine Laboratory of the University of Hawaii. Honolulu, USA. 45 pp.
Patwardhan, A.; Ray, S.; Roy, A. 2014. Molecular Markers in Phylogenetic Studies-A Review. Journal of Phylogenetics & Evolutionary Biology 02(02): 1-9.
Pülmanns, N.; Diele, K.; Mehlig, U.; Nordhaus, I. 2014. Burrows of the Semi-Terrestrial Crab Ucides cordatus Enhance CO2 Release in a North Brazilian Mangrove Forest. PLoS ONE 9(10): e109532.
Ratti, M.F.; Muñoz, M. 2010. Optimización del sistema AFLP para determinación de la variabilidad genética de Ucides occidentalis en tres zonas de manglar del Golfo de Guayaquil. Escuela Superior Politécnica del Litoral. Guayaquil, Ecuador. 6 pp.
Sarower, M.G.; Shahriar, S.I.M.; Nakamura, H.; Rouf, M.A.; Okada, S. 2017. Taxonomic confirmation of mud crab species (Genus scylla) in Bangladesh by nuclear and mitochondrial DNA markers. Mitochondrial DNA Part A 28(6): 935-940.
Shih, C.H.; Haung, H.L.; Chu, T.J.; Lee, Y.C.; Wang, C.M.; Tzeng, T.D. 2011. Genetic diversity and historical demography of kuruma shrimp (Penaeus japonicus) species complex off China based on mitochondrial DNA analysis. African Journal of Biotechnology 10(7): 1065 - 1072.
Shih, H.T.; Saher, N.U.; Kamrani, E.; Ng, P.K.; Lai, Y.C.; Liu, M.Y. 2015. Population genetics of the fiddler crab Uca sindensis (Alcock, 1900) (Crustacea: Brachyura: Ocypodidae) from the Arabian Sea. Zoological Studies 54(1): 1-10.
Weinberg, J.R.; Dahlgren, T.G.; Trowbridge, N.; Halanych, K.M. 2003. Genetic Differences within and between species of Deep-Sea Crabs (Chaceon) From the North Atlantic Ocean. Biol. Bull. 204(3): 318-326
Zambrano, R. 2017. First record of malformations in males of Ucides occidentalis (Brachyura, Ocypodidae) in the Gulf of Guayaquil, Ecuador. Crustaceana 90(5): 631-638.
Zambrano, R.; Meiners, C. 2018. Notas sobre taxonomía, biología y pesquería de Ucides occidentalis (Brachyura: Ocypodidae) con énfasis en el Golfo de Guayaquil, Ecuador. Revista Peruana de Biología 25(1): 055-066.
Received April 12, 2018.
Accepted May 11, 2018.
Corresponding author: aordinolaz@untumbes.edu.pe (A. Ordinola-Zapata).
Downloads
Publicado
Como Citar
Edição
Seção
Licença
Los autores que publican en esta revista aceptan los siguientes términos:
a. Los autores conservan los derechos de autor y conceden a la revista el derecho publicación, simultáneamente licenciada bajo una licencia de Creative Commons que permite a otros compartir el trabajo, pero citando la publicación inicial en esta revista.
b. Los autores pueden celebrar acuerdos contractuales adicionales separados para la distribución no exclusiva de la versión publicada de la obra de la revista (por ejemplo, publicarla en un repositorio institucional o publicarla en un libro), pero citando la publicación inicial en esta revista.
c. Se permite y anima a los autores a publicar su trabajo en línea (por ejemplo, en repositorios institucionales o en su sitio web) antes y durante el proceso de presentación, ya que puede conducir a intercambios productivos, así como una mayor citación del trabajo publicado (ver efecto del acceso abierto).
