Molecular identification and prevalence of fungal contaminants in seeds of semi-annual crops

Authors

  • Manuel Alfonso Patiño-Moscoso Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA, Sede Central, Departamento de Semillas. Km 14 vía Mosquera-Bogotá
  • Karen Viviana Osorio-Guerrero Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA, Sede Central, Departamento de Semillas. Km 14 vía Mosquera-Bogotá
  • Deisy Lorena Flórez-Gómez Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria – AGROSAVIA
  • Luisa Fernanda Sarmiento-Moreno Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria – AGROSAVIA
  • David Napoleón Vargas-Ramírez Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria – AGROSAVIA

DOI:

https://doi.org/10.17268/sci.agropecu.2023.030

Keywords:

plant health, Seed quality, seed crops, pathogenic fungi, seedborne pathogens

Abstract

Seed quality is affected by fungal contamination. These cause abortion, rot, or necrosis of the seed, as well as seedling damage that results in the development of diseases in later stages of growth. Their identification and characterization are essential to establish appropriate management. The objective of this work was to identify and determine the prevalence of fungal contaminants present in the seed of thirteen plant varieties of rice, soybean, corn, and forage sweet sorghum produced in the municipality of El Espinal, Tolima, Colombia. This research was carried out at the Tibaitatá Research Center of the Colombian Agricultural Research Corporation AGROSAVIA (Cundinamarca, Colombia) during the second semester of 2021. By means of a blotter test, fungal contaminants and their prevalence in germinated and non-germinated seeds were identified. A total of 65 fungal isolates were obtained, which were grouped into twenty-eight molecularly identified morphotypes (44 soybean, 5 rice, 7 sorghum and 9 corn). The genera Diaporthe and Fusarium were the ones with the highest total prevalence and in ungerminated seeds. The fungi found include possible pathogens such as Fusarium spp, Curvularia spp and Diaporthe spp. and saprophytic fungi such as Penicillium spp and Aspergillus spp. The isolates of Fusarium equiseti and Diaporthe sp. in soybean seed, Curvularia penniseti in rice seed, Diaporthe melonis in sorghum seed and Fusarium verticillioides in corn seed can be considered as potential seed-borne pathogens that caused a negative effect on germination capacity.

Author Biographies

Deisy Lorena Flórez-Gómez, Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria – AGROSAVIA

Ingeniera Agrónoma de la Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales UDCA, candidata al título de Maestría Profesional en Tecnología de Semillas de la Universidad de Guadalajara, con experiencia en investigación agrícola. Actualmente se encuentra vinculada al Departamento de Semillas de la Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA) como Profesional de Apoyo a la Investigación. Tiene conocimientos en producción de semillas de calidad, mejoramiento genético, diseño experimental y análisis estadístico.

Luisa Fernanda Sarmiento-Moreno, Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria – AGROSAVIA

Magister en Agronegocio e ingeniera agrónoma, con experiencia profesional en gestión, formulación, estructuración, evaluación y seguimiento de proyectos de investigación, vinculación, económicos de producción, análisis técnico para la formulación de política agropecuaria y en gestión,  coordinación, implementación, seguimiento a convenios y proyectos agropecuarios, en los últimos 6 años me he desempeñado en el diseño e implementación de proyectos de fortalecimiento de sistemas locales de semillas mediante el plan nacional semilla, proyectos con comunidades indígenas y la producción y recuperación de semillas de las ofertas tecnológicas de AGROSAVIA. Actualmente está asociado al Departamento de Semillas de Agrosavia con el cargo de Coordinadora de producción de semilla.

David Napoleón Vargas-Ramírez, Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria – AGROSAVIA

Ingeniero Agrónomo, se desempeña como Profesional de Apoyo a la Investigación en el C.I. Tibaitatá de la Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA). Con experiencia superior a 15 años en asistencia técnica, planeación, diseño de sistemas agrícolas, agroindustriales y coordinación de proyectos productivos.

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Published

2023-09-18

How to Cite

Patiño-Moscoso, M. A., Osorio-Guerrero, K. V. ., Flórez-Gómez, D. L. ., Sarmiento-Moreno, L. F. ., & Vargas-Ramírez, D. N. . (2023). Molecular identification and prevalence of fungal contaminants in seeds of semi-annual crops . Scientia Agropecuaria, 14(3), 347-358. https://doi.org/10.17268/sci.agropecu.2023.030

Issue

Section

Original Articles