COMPARACIÓN DE TRES PROTOCOLOS DE EXTRACCIÓN DE  ADN EN Myliobatis peruvianus

Carlos Alfonso  Lino Amaya; Carlos Helí Quijano Jara; Cinthya Santa Cruz López

Authors

Carlos Alfonso Lino Amaya Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Nacional de Trujillo, Av. Juan Pablo II s/n – Ciudad Universitaria, Trujillo, Perú. https://orcid.org/0009-0001-6667-2120
Carlos Helí Quijano Jara Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Nacional de Trujillo, Av. Juan Pablo II s/n – Ciudad Universitaria, Trujillo, Perú. https://orcid.org/0000-0001-9269-9864
Cinthya Santa Cruz López Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad Nacional de Jaén, Carretera Jaén - San Ignacio KM 24 - Sector Yanuyacu - Jaén https://orcid.org/0000-0002-7352-058X

Keywords:

Myliobatis peruvianus, calidad, concentración

Abstract

Myliobatis peruvianus “raya” es una especie catalogada en peligro (EP) a nivel regional en base a la drástica disminución en los embarques de la especie en un 90%. Existe además falta de información de la especie en diferentesaspectos como la profundidad máxima que frecuenta; longevidad, tasa de incremento poblacional, careciendo también de información genética mediante el uso de marcadores moleculares de ADN, es por ello que el objetivo de la presente investigación comparar tres protocolos de extracción de ADN para su posterior uso en estudios genéticos mediante el uso de marcadores moleculares de ADN. Se utilizaron tres protocolos de extracción los cuales fueron Fenol-Cloroformo, Sal común y Mezzomo, se midió la concentración y calidad de ADN con NanoDrop One C, los datos se sometieron a un análisis de varianza y a una prueba de comparaciones múltiples de Tukey, se obtuvo ADN de buena calidad en los protocolos de Sal común y Fenol-cloroformo; mientras que respecto a la concentración de ADN el protocolo que dio mejor resultado fue el de Sal común.

DOI: http://dx.doi.org/10.17268/rebiol.2022.42.02.14

References

Adcodk, G.J., Bernal Ramázrez, J.H., Hauser, L., Smith, P. and Carvalho, G.R. (2000), Screening of DNA polymorphisms in samples of archived scales from New Zealand snapper. Journal of Fish Biology, 56, 1283-1287.

Aranishi, F. 2006. Single fi sh egg DNA extraction for PCR amplifi cation. Conservation Genetics 7,153-156.

Astorga, M. P. (2008). Estado actual del uso de marcadores moleculares en moluscos bivalvos de importancia para la acuicultura. En A. Lovatelli, A. Farías & I. Uriarte (Eds.). Estado actual del cultivo y manejo de moluscos bivalvos y su proyección futura Factores que afectan su sustentabilidad en América Latina. (pp. 277 –287). Puerto Montt, Chile: Taller Técnico Regional de la FAO.

Chakraborty, A., Sakai, M. y Iwatsuki, Y. (2006), Museum fish specimens and molecular taxonomy: A comparative study on DNA extraction protocols and preservation techniques. Journal of Applied Ichthyology, 22, 160-166

Checa, R. A. (2017). Extracción de ADN. Bioquímica y biología molecular, Pg. 3-4.

Chirichigno N, Velez J. (1998). Clave para Identificar los Peces Marinos del Perú. 2ed. Lima, Perú: IMARPE.

Coello, D., & Herrera, M. (2010). Diversidad de peces demersales en la plataforma continental de Ecuador. Rev. Cienc. Del Mar y Limnologia. 4 (1), 54-64.

Cummings, S. A., & Thorgaard, G. H. (1994). Extraction of DNA from fish blood and sperm. BioTechniques, 17(3), 426-430.

De Armas R, Rodríguez MM, Bisset JA, Fraga J. (2005). Modificación de un método de extracción de ADN genómico de Aedes aegypti (Diptera: Culicidae). Rev Colomb Entomol. 31(2), 203-206.

Dundass, B. (2008). Comparación de los métodos de extracción de ácidos nucleicos automatizados con la extracción manual. Diagnosticos moleculares, 311- 316.

Ferrer E., Da Conceicão, F., Campioli. P, Lares M, López M, Rivera MG, Viettri M, Medina M, Salcedo M, Morocoima A, Herrera L. (2009). Validación de protocolos de PCR para el diagnóstico molecular de la enfermedad de Chagas. Salus, 12(S1), 163- 174.

Fricke, R., Eschmeyer, W. N., & Van Der Laan, R. (2020). Eschmeyer’s Catalog of Fishes: genera, species, references. Updated

García N. L. C. (2012). Caracterización morfológica y molecular de 34 colectas nativas de jitomate (Solanum lycopersicum L.). Tesis de Maestría en Biotecnologia Agricola. Departamento de Fitotecnia. Universidad Autónoma Chapingo. 56p.

Lamilla, J. 2004. Rhinobatos planiceps. In: IUCN 2013. IUCN Red List of Threatened Species. Version 2013.2.

Lamilla, J., & Sáez, S. (2003). Clave taxonómica para el reconocimiento de especies de rayas chilenas (Chondrichthyes,

Batoidei). Investigaciones Marinas, 31(2), 3-6.

Lopera-Barrero, N.M., Ribeiro, R.P., Sirol, R.N., Povh, J.A., Gomes, P.C., Vargas, L., & Streit, J. (2006). Genetic diversity in piracanjuba populations (Brycon orbignyanus) with the RAPD (Random Amplifi ed Polimorphic DNA) markers. Journal Animal Science 84,170.

Lopera-Barrero, N., Povh, J.A., Ribeiro, R.P., Gomes, P.C., Jacometo, C.B., & Da Silva T. (2008). Comparación de dos protocolos de extracción de ADN con muestras de aletas y larvas de peces extracción modificada en cloruro de sodio. Cien Inv Agr, 35(1), 77-86.

Monsalve, E. V. (2016). Categorización de especies marinas de mayor importancia comercial de la pesquería artesanal en la Región Lambayeque según los criterios de la Lista Roja Regional de la UICN. Universidad Nacional Pedro Ruiz Gallo. Lambayeque, Perú.

Nam, Y. K., Park, J. E., Kim, K. K., y Kim, D. S. (2003). A rapid and simple PCR-based method for analysis of transgenic fish using a restricted amount of fin tissue. Transgenic research, 12(4), 523–525.

Sambrook, J., Fritsch, E.F., y Maniatis, T., (1989). Clonación molecular: un manual de laboratorio, 2ª ed. Prensa de laboratorio de Cold Spring Harbor, Cold Spring Harbor, Nueva York.

Taberlet, P., Griffin, S., Goossens, B., Questiau, S., Manceau, V., Escaravage, N., Waits, L. P., y Bouvet, J. (1996). Reliable

genotyping of samples with very low DNA quantities using PCR. Nucleic acids research, 24(16), 3189-3194.

Wasko, A. P., Martins, C., Oliveira, C., y Foresti, F. (2003). Nondestructive genetic sampling in fish. An improved method for DNA extraction from fish fins and scales. Hereditas, 138(3), 161-165.

Weber, L.P., Higgins, P.S., Carlson, R.I. y Janz, D.M. (2003), Development and validation of methods for measuring multiple biochemical indices of condition in juvenile fishes. Journal of Fish Biology, 63, 637-658.

Yue, G. H., & Orban, L. (2001). Rapid isolation of DNA from fresh and preserved fish scales for polymerase chain reaction. Marine biotechnology, 3(3), 199-204.